云霄阁于1582年（明万历十年）重修，距今己有400多年历史，系土木结构，呈迭式塔形，共七层，高20多米。底层分前后两座：前堂为夫人宫，门前有联云：“黄鹤归来带得松花香丈室，白云飞去放开明月照禅心”。后堂为仙师殿，供奉仙师菩萨，有联云“佛地有尘风自扫，禅寺无锁月常关”。第二层为观音殿，奉观音佛像，有联曰“紫金山清源山不如此处神灵救灾更快，禅林寺义合寺总是共个菩萨求福在诚”。第三层为玄天帝殿，第四层为北帝祖师殿，第五层天后圣母殿，第六层为魁星点斗殿，第七层为钟鼓。
云霄阁第一、二层为生土建筑，墙厚二尺，三层开始为圆柱顶立，木板为屏，开花板有五彩花纹，檐头八角翘鳖，葫芦屋顶，有木梯直通各层。
