《四库全书》按照内容分类为：
一、文类四部：
1.《史籍》：以编年体为主的史学著作，如尚书、禹贡、春秋等；
2.《子集》：以文学著作为主的思想、文化、礼仪等内容，如诗经、礼记、孟子等；
3.《古文》：以诗词、楚辞、楔子等为主的古文著作；
4.《综合》：其它文学作品，如传奇、小说、史实等。
二、子类六部：
5.《儒家》：先秦游方学者的学术著作，如孟子、荀子、韩非子等；
6.《释家》：出现在中国佛教文献中的学术著作，如《藏经》、《大乘起信论》、《华严经》等；
7.《道家》：出现在中国道教文献中的学术著作，如《易经》、《道德经》、《四书》等；
8.《外家》：出现在中国包括拓片和吐谷浑文献中的学术著作，如《九章算术》、《淮南子》、《集解》等；
9.《术数》：关于辩音、占卜、风水、印刻等术数著作，如《易传》、《灵枢》、《比色》等；
10.《医家》：以医学著作为主的一组文献，如《黄帝内经》、《伤寒论》、《神农本草经》等。
